Группа ученых Национального института здравоохранения разработала новый инструмент для выявления широко нейтрализующих антител (bNAb), способных предотвратить заражение большинством штаммов ВИЧ, обнаруженных по всему миру, – прогресс, который может помочь ускорить исследования вакцины против ВИЧ.
Ученые долгое время изучали ВИЧ-инфицированных людей, чья кровь проявляет мощную нейтрализующую активность, поскольку понимание того, как bNAb ВИЧ развиваются и атакуют вирус, может дать ключ к разгадке конструкции вакцины против ВИЧ. Но до сих пор доступные методы анализа образцов крови не давали с легкостью конкретной информации о присутствующих bNAb ВИЧ или частях вируса, на которые они нацелены. Кроме того, определение того, где и как bNAb ВИЧ связываются с вирусом, было трудоемким процессом, включающим несколько сложных методов и относительно большое количество крови от отдельных доноров.
Новый инструмент позволяет ученым точно определять bNAb ВИЧ, присутствующие в конкретном образце крови, путем анализа там нейтрализованных штаммов ВИЧ. Инструмент, называемый нейтрализацией отпечатков пальцев, представляет собой математический алгоритм (процедуру решения проблем), который использует большой объем данных о bNAb ВИЧ, полученных в последние годы. Отпечаток нейтрализации антитела к ВИЧ – это показатель того, какие штаммы вируса оно может блокировать и с какой интенсивностью. Антитела, нацеленные на одну и ту же часть вируса, как правило, имеют похожие отпечатки пальцев.
Образцы крови содержат смеси антител, поэтому новый алгоритм вычисляет конкретные типы присутствующих bNAb ВИЧ и их долю путем сравнения данных нейтрализации крови с отпечатками пальцев известных bNAb ВИЧ. Этот подход особенно полезен, когда другие методы определения целей bNAbs в образце крови невозможны, например, когда доступно лишь небольшое количество крови. Снятие отпечатков пальцев нейтрализации также выполняется значительно быстрее, чем старые аналитические методы. По словам исследователей, которые разработали анализ, основной подход может быть применен к изучению реакции человека на другие патогены, такие как вирусы гриппа и гепатита С, для которых ученые имеют много информации о нейтрализующих антителах.