Согласно отчету, опубликованному в Журнале экспериментальной медицины, ученые нашли способ найти пресловутую иголку в стоге сена ракового антигена.
По мере деления раковые клетки накапливают случайные ошибки (мутации). Этот процесс создает новые версии белков, некоторые из которых распознаются иммунными клетками, называемыми Т-клетками, как чужеродные захватчики, побуждая клетки атаковать и уничтожать раковые клетки. Благодаря нашей нынешней способности идентифицировать все мутации в раке пациента и понимать, какие белковые последовательности могут распознаваться Т-клетками, ученые теперь могут предсказать, какие мутации приведут к появлению новых Т-клеток-мишеней (называемых "неоэпитопы"). Некоторые из этих неоэпитопов затем могут быть использованы в качестве вакцин для индукции защитного Т-клеточного ответа, который уничтожает рак.
Но вот в чем загвоздка. Эти инструменты прогнозирования генерируют сотни возможных неоэпитопов, из которых лишь небольшая часть может действительно вызывать Т-клетки, способные атаковать опухоль. И до сих пор не существовало надежного общего знаменателя, который помог бы определить эту полезную горстку.
Предыдущие попытки предсказать неоэпитопы рака основывались на том, насколько сильно мутировавший белок распознается иммунной системой. Но ученые из Университета Коннектикута теперь показывают, что сила этого взаимодействия – плохой предсказатель. Лучшим (хотя и несовершенным) показателем оказывается, насколько по-разному выглядит мутация для Т-клетки по сравнению с ее нормальным аналогом – чем отчетливее, тем лучше. Эти результаты могут полностью изменить существующие подходы к созданию противоопухолевых вакцин.