20010,0,3500,
Исследование, изданное сегодня по своей природе, было во главе с Университетами Бирмингема и Оксфорда в сотрудничестве с FioCruz Баией, Университетом Сан-Паулу, и поддержало бразильским Министерством здравоохранения.Выполняя геном, упорядочивающий, чтобы понять генетическую косметику вируса, команда смогла отследить распространение вируса по Бразилии. Исследование показало, что учреждение Зика в Бразилии – и ее распространение оттуда в другие регионы – произошли, прежде чем передача Зика в Америках была сначала обнаружена.
Показывая эту ‘скрытую’ эпидемию, результаты помогут ученым лучше понять связь между эпидемией Зика и сообщениями о врожденных дефектах и других болезнях.С мало известным в то время приблизительно эпидемиология и эволюция вируса Зика, исследователи путешествовали 2 000 км по северо-восточной Бразилии в июне в прошлом году. Команда путешествовала в микроавтобусе, оборудованном ультрасовременными мобильными возможностями упорядочивающего ДНК, и проверила образцы больше чем от 1 300 пациентов, зараженных вирусом.
В феврале 2016 Зика был объявлен ‘Чрезвычайной ситуацией здравоохранения Международного Беспокойства’ Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) в ответ на доказательства, что инфекция может вызвать врожденные дефекты в плодах зараженных беременных женщин. Вирус может быть передан от зараженной беременной женщины ее развивающемуся ребенку, вызвав проблемы включая тяжелую микроцефалию – условие, которое приводит к младенцам, рождающимся с меньшим размером головы.Доктор Нуну Фариа, Отдела Оксфордского университета Зоологии, сказал: «Несмотря на то, чтобы там быть, вероятно, миллионами случаев вируса Зика в Бразилии, была только горстка известных вирусных геномов до нашей работы. Лучшее понимание генетического разнообразия вируса Зика очень важно для дизайна вакцины, и также определить области, где наблюдение больше всего необходимо».
Профессор Оливер Пайбус, также Отдела Оксфордского университета Зоологии сказал, что «Мы произвели вирусные геномы Зика, чтобы установить эпидемическую историю вируса в Америках. Мы показали, что вирус присутствовал в Бразилии в течение целого года до первых подтвержденных случаев в мае 2015.«Мы также нашли, что северо-восточная Бразилия, которая была регионом с наиболее зарегистрированными случаями Зика и микроцефалии, была связью эпидемии в Бразилии и играла ключевую роль в ее распространении в Бразилии в крупнейшие городские центры, такие как Рио-де-Жанейро и Сан-Паулу, прежде, чем распространиться через Америки. У нас теперь есть лучшее понимание эпидемиологии вируса».
Во время поездки упорядочивающего генома, которая поехала по Бразилии, исследователи использовали портативную программу упорядочения ДНК MinION от компании Oxford Nanopore Technologies, которая начала как Оксфордский университет spinout компанию. Портативное устройство весит меньше чем 100 г и приведено в действие USB-портом ноутбука, также – идеально для полевых исследований по пересеченной местности.Профессор Ник Ломен, Школы Бирмингемского университета Биологических наук, сказал: «Упорядочивающий геном стал мощным инструментом для изучения появляющихся инфекционных заболеваний, однако, геном, упорядочивающий непосредственно от клинических образцов без изоляции, остается сложным для вирусов, таких как Зика.«Мы разработали новый протокол, который допускает геномное упорядочивание в реальном времени – что-то вроде огромной важности, справляясь с вирусными вспышками, поскольку это может обеспечить реальное понимание, как вирус распространяется, передавая и развиваясь.
«Кроме того, используя оборудование как портативная нанопора, упорядочивающая, мы смогли провести чрезвычайное эпидемиологическое исследование более быстро, получить непосредственные результаты, работая в области, как на дороге в Бразилии.«Этот новый протокол, несомненно, окажется чрезвычайно выгодным для исследователей, работающих в отдаленных районах во всем мире во времена вирусных вспышек».Научно-исследовательская работа была финансирована Зика Совета по медицинским исследованиям Быстрая Инициатива Ответа, АМР США, и поддержана Wellcome Trust и Фондом Ньютона. Это подчеркивает важность создания поперечных установленных партнерств, которым доверяют, и обменивание данными открыто во время болезни сосредоточило полевые исследования исследования.
Что является следующим? Профессор Луис Алькантара от FioCruz Баия, Бразилия намекает что: «Проект теперь расширяется до других географических областей в Бразилии, где мы занимаемся не только вирусом Зика, но также и лихорадкой и chikungunya вирусами, а также очень недавними продолжающимися эпидемиями желтой лихорадки.
Угроза, представленная от вирусов, переданных москитами в Бразилии, серьезна и есть срочная необходимость лучше понять их эпидемиологию, чтобы предотвратить их распространение».Как часть совместных международных усилий разделить ценные данные и результаты, отчет был опубликован вместе с двумя сопутствующими статьями о генетике, и эволюция вирусной эпидемии Зика (для получения дополнительной информации см. DOI: 10.1038/nature22400 и DOI: 10.1038/nature22402).
Зика остается значительной угрозой здравоохранения, и исследование подчеркивает потребность в длительном исследовании и наблюдении Зика и других переданных москитом вирусов в Бразилии. Вместе, бумаги рисуют коллективную картину масштаба воздействия Зика, предлагая потенциальные рекомендации для будущего быстрого обнаружения и контроля вирусных эпидемий.