В исследовании секвенирования генома 74 опухолей нейробластомы у детей ученые из Онкологического центра Джонса Хопкинса Киммела и Детской больницы Филадельфии (CHOP) обнаружили, что пациенты с изменениями в двух генах, ARID1A и ARID1B, выживают только на четверть меньше, чем пациенты. без изменений. Открытие может в конечном итоге привести к раннему выявлению пациентов с агрессивными нейробластомами, которым может потребоваться дополнительное лечение.
Нейробластомы поражают нервную ткань по всему телу и являются наиболее распространенным не относящимся к крови раком у детей. "Эти виды рака имеют широкий спектр клинических исходов, некоторые из которых хорошо поддаются лечению, а другие – очень летальны," говорит Виктор Велкулеску, M.D., Ph.D., профессор онкологии и содиректор программы биологии рака в Johns Hopkins. "Частично причина такого разнообразия прогнозов может быть связана с изменениями генов ARID1A и ARID1B."
Велкулеску сказал, что эти мощные "терроризировать" гены не были идентифицированы в других исследованиях нейробластомы по секвенированию генов, скорее всего потому, что исследователи Johns Hopkins-CHOP использовали методы секвенирования и анализа, которые искали более крупные структурные перестройки ДНК в дополнение к изменениям в последовательности отдельных химических пар оснований, которые образуют ДНК. Отчет об их работе появится в декабре. 2 выпуск журнала Nature Genetics.
Из 74 опухолей в исследовании 71 была проанализирована как на перегруппировку, так и на изменения пар оснований. Специфические для рака мутации были обнаружены во множестве генов, ранее связанных с нейробластомой, включая гены ALK и MYCN. У восьми из 71 пациента исследователи обнаружили изменения в генах ARID1A и ARID1B, которые обычно контролируют укладку ДНК, позволяя или блокируя производство белка.
Дети с изменениями генов ARID1A или ARID1B в среднем имели гораздо худшую выживаемость, чем дети без генетических изменений – 386 дней по сравнению с 1689 днями. Все эти пациенты, кроме одного, умерли от прогрессирующей болезни, в том числе один ребенок, нейробластома которого считалась хорошо излечимой.
Ученые также смогли обнаружить и контролировать специфические для нейробластомы генетические изменения в крови четырех пациентов, включенных в исследование, и сопоставить эти результаты с прогрессированием заболевания.
"Обнаружение специфических для рака изменений в крови может помочь клиницистам контролировать пациентов на предмет рецидива и определять, остаются ли остаточные раковые клетки в организме после операции," говорит Марк Саузен, аспирант Университета Джонса Хопкинса и один из ведущих ученых, участвовавших в исследовании.
Команда Johns Hopkins-CHOP планирует провести дальнейшие исследования на более крупных группах пациентов, чтобы подтвердить корреляцию ARID1A-ARID1B с прогнозом.