Курение – хорошо известный фактор риска рака легких, но почти 25% всех больных раком легких никогда не курили. В исследовании, опубликованном сегодня в Интернете в Genome Research, исследователи определили ранее неизвестное событие слияния генов, которое могло бы объяснить значительную долю случаев рака легких у никогда не куривших, и могло бы служить целью для новых методов лечения.
В последнее время были предприняты шаги по выявлению событий генной мутации, приводящих к развитию аденокарциномы легких у никогда не куривших, но лежащие в основе генетические события, приводящие к этим видам рака легких, во многих случаях остаются неизвестными. В этом отчете, используя комбинацию секвенирования генома и секвенирования РНК, группа исследователей из Южной Кореи охарактеризовала ранее неизвестное событие слияния генов в случае аденокарциномы легких, поразившей 33-летнего корейского мужчины, не курившего или не курящего в анамнезе. рак в его семье.
Группа секвенировала и сравнила геном рака пациента и нормальной ткани (крови), но они не обнаружили мутаций в генах, связанных с известным раком, таких как мутации EGFR, KRAS и EML4-ALK, которые могли бы объяснить этот случай. Проникнув глубже, они также секвенировали РНК, выделенную из раковых клеток, которая при анализе может выявить события перестройки генов, которые трудно обнаружить с помощью секвенирования генома и которые могут быть причиной рака.
На основе анализа секвенирования РНК они составили список слияний генов-кандидатов, сужая его до слияния одного гена, которое могло быть причиной рака. Событие инверсии генома произошло на хромосоме 10 в раке, в результате слияния генов KIF5B и RET. Это слияние было особенно интересно, потому что RET ранее был вовлечен в другие события слияния генов, которые, как известно, вызывают рак щитовидной железы, и, хотя он обычно экспрессируется на низких уровнях в легких, химерный RET у этого пациента выражен высоко. Кроме того, KIF5B содержит белковый домен, необходимый для активации гибридного гена.
Затем они подтвердили, что слияние KIF5B-RET происходит в других случаях рака легких, обнаружив два случая из двадцати дополнительных случаев рака легких, что указывает на то, что это слияние не является редкостью. Авторы предполагают, что слияние KIF5B-RET встречается примерно в 6% всех случаев аденокарциномы легких. Авторы отмечают, что, хотя необходимы дальнейшие эпидемиологические исследования для точного определения частоты KIF5B-RET при раке легких, они ожидают, что гибридный ген может быть многообещающей молекулярной мишенью для лечения.
"Мы показали, что технология секвенирования генома может выявить ранее скрытую причину рака человека, которую можно использовать в качестве терапевтической мишени для индивидуальной терапии рака", сказал доктор. Чон-Сун Со, директор Института геномной медицины Сеульского национального университета, председатель Macrogen Inc., и старший автор исследования.