Генетический полиморфизм, связанный с прогрессированием рака, приводит к вариациям в экспрессии генов и может служить прогностическим маркером рака легких. Исследователи из Университета Хиросимы и Медицинского университета Сайтамы обнаружили, что у пациентов с раком легких однонуклеотидный полиморфизм (SNP) может регулировать экспрессию генов и белков и быть связан с плохим прогнозом. Чтобы установить этот генетический полиморфизм как полезный клинический прогностический маркер и дополнительно прояснить его молекулярный механизм, необходимы крупномасштабные клинико-патологические исследования рака легких и / или других типов рака для получения дополнительных сведений.
Индуцируемый гипоксией фактор-2 альфа (HIF-2 альфа или EPAS1) важен для прогрессирования рака, а его сверхэкспрессия считается предполагаемым биомаркером плохого прогноза у пациентов с раком легких. Однако молекулярные механизмы, лежащие в основе сверхэкспрессии EPAS1, полностью не изучены. Недавно сообщалось, что несколько SNP EPAS1 связаны с развитием различных заболеваний, включая рак.
Доктор. Кейджи Танимото из Университета Хиросимы и его сотрудники сосредоточились на SNP в EPAS1. Они изучили роль этих SNP в регуляции экспрессии гена EPAS1 и связь этих SNP с прогнозом пациентов с раком легких с помощью биоинформатического анализа.
"Было показано, что несколько SNP EPAS1 коррелируют с различными заболеваниями, но их механизм почти не известен," сказал доктор. Танимото. Он продолжил, "SNP в области интрона 1 EPAS1 может влиять на экспрессию гена и белка EPAS1, и наличие аллеля A (аденин) EPAS1, а не аллеля G (гуанин), связано с плохим прогнозом у пациентов с раком легких."
Была оценена связь SNP в области EPAS1 с общей выживаемостью пациентов с раком легкого. Среднее время выживания пациентов с хотя бы одним аллелем A было значительно короче, чем у пациентов с аллелем G (28.0 месяцев vs. 52.5 месяцев).
Более того, раковые клетки с аллелем A EPAS1 показали более высокую экспрессию гена и белка EPAS1 в экспериментах in vitro. Было высказано предположение, что аллель A EPAS1 играет важную роль в прогрессировании рака легких, регулируя экспрессию гена и белка EPAS1.
"Помимо рака легких, другие виды рака, такие как рак прямой кишки, рак головы и шеи, также имели плохой прогноз, связанный со сверхэкспрессией EPAS1. После подтверждения наших наблюдений крупномасштабными исследованиями в будущем, генотипирование SNP EPAS1 может стать клинически полезным инструментом для персонализированных медицинских осмотров и лечения рака." Доктор. Танимото объяснил.