Новая классификация рака толстой кишки на основе транскриптомов, которая улучшает стратификацию текущего заболевания на основе клинико-патологических переменных и общих маркеров ДНК, представлена в исследовании, опубликованном на этой неделе в журнале PLOS Medicine. (Транскриптом – это вся РНК, продуцируемая популяцией клеток.) Pr. Пьер Лоран-Пуч и его коллеги из INSERM в Париже, Франция использовали генетическую информацию из французского многоцентрового исследования при поддержке "Ligue contre le рак" определить стандартную воспроизводимую молекулярную классификацию на основе анализа экспрессии генов колоректального рака. Авторы также оценили, существуют ли какие-либо ассоциации между идентифицированными молекулярными подтипами и клиническими и патологическими факторами, общими изменениями ДНК и прогнозом.
Рак толстой кишки (колоректальный рак) – третий по распространенности рак у мужчин и второй по частоте рак у женщин во всем мире. Несмотря на недавние достижения в области скрининга, диагностики и лечения колоректального рака, около 608 000 человек ежегодно умирают от этой формы рака – 8% всех случаев смерти от рака. Варианты прогноза и лечения колоректального рака зависят от пяти патологических стадий (0 – IV), каждая из которых имеет свой вариант лечения и пятилетнюю выживаемость, поэтому важно правильно определить стадию. К сожалению, патологическая стадия не позволяет точно предсказать рецидив (рецидив) у пациентов, перенесших операцию по поводу локализованного колоректального рака.
Авторы использовали генетическую информацию от когорты из 750 пациентов с колоректальным раком I-IV стадии, перенесших операцию в период с 1987 по 2007 год в семи центрах во Франции. Исследователи определили соответствующую клиническую и патологическую информацию о стадиях для каждого пациента из медицинских карт и рассчитали выживаемость без рецидива (время от операции до первого рецидива) для пациентов со стадией II или III. Используя эти методы, авторы классифицировали образцы рака толстой кишки на шесть молекулярных подтипов (на основе данных по экспрессии генов). Важно отметить, что исследователи обнаружили, что шесть идентифицированных подтипов были связаны с различными клиническими и патологическими характеристиками, молекулярными изменениями, специфическими сигнатурами экспрессии генов и дерегулированными сигнальными путями. В прогностическом анализе исследователи обнаружили, что пациенты, чьи опухоли были классифицированы в кластеры C1-C3 или C5, имели на 50% большую вероятность безрецидивной выживаемости, чем пациенты с кластерами C4 или C6, даже с поправкой на возраст, пол и рак. стадия и оценка рецидива онкотипа (отношение рисков, 1.5, 95% доверительный интервал 1.1-2.1, P = 0.0097).
Сильные стороны исследования включают в себя большие хорошо изученные образцы рака толстой кишки, полученные из нескольких центров, и проверку с использованием независимого набора данных. Однако это исследование было ретроспективным и не включало некоторые известные предикторы прогноза колоректального рака, такие как степень опухоли и количество исследованных узлов. Значимость и надежность прогностической классификации требует дальнейшего подтверждения на больших потенциальных когортах пациентов.
Авторы делают вывод, "Мы описываем первую, насколько нам известно, надежную классификацию на основе транскриптомов, которая улучшает текущую стратификацию заболевания на основе клинико-патологических переменных и общих маркеров ДНК. Биологическая значимость этих подтипов подтверждается значительными различиями в прогнозе. Этот анализ предоставляет возможности для улучшения прогностических моделей и терапевтических стратегий."