Исследователи определили новую мутацию, которая может быть связана с раком простаты у афроамериканских мужчин, согласно новому исследованию, опубликованному в PLOS Computational Biology.
Ученым давно известно, что огромное количество разнообразных мутаций ДНК может привести к раку. Некоторые белки могут восстанавливать мутации ДНК, но когда репарационные белки мутируют сами, может возникнуть рак. Знание того, какие мутации связаны с какими типами рака, помогает ученым разрабатывать новые целевые методы лечения и стратегии обнаружения.
Чтобы улучшить знания о мутациях, связанных с раком простаты, Элис Уокер из Университета Северного Техаса и ее коллеги провели поиск соответствующих мутаций в генах, которые кодируют семейство белков репарации ДНК, известных как AlkBH.
Исследователи запустили два отдельных набора данных последовательностей ДНК с помощью программного обеспечения под названием HyDn-SNP-S, которое ранее было разработано членами команды. Программное обеспечение позволило им сравнить последовательности ДНК белков семейства AlkBH из здоровых геномов с последовательностями, обнаруженными в геномах, полученных из опухолей рака простаты. В обоих наборах данных мутация в гене, кодирующем белок под названием ALKBH7, была в значительной степени связана с раком простаты у афроамериканских мужчин.
Затем исследователи использовали компьютерное моделирование, чтобы изучить, как мутация ALKBH7, R191Q, повлияет на структуру белка. Они обнаружили, что мутация может вызвать структурное изменение, которое значительно снижает способность белка выполнять свою нормальную роль. Спектроскопические эксперименты с реальными образцами белка подтвердили эти прогнозы.
По данным соавтора исследования Г. Андрес Сиснерос из Университета Северного Техаса, следующие этапы исследования – это дальнейшее экспериментальное изучение того, как мутация R191Q связана с раком простаты, а также исследование потенциальных новых путей обнаружения и лечения на основе мутации.
"Сканирование ДНК людей в целевой популяции на предмет этой мутации может помочь выявить людей с более высоким риском развития рака простаты до того, как симптомы станут очевидными," Уокер говорит.