Новый подход к изучению рака позволил исследователям сгруппировать около 10 000 раковых опухолей человека 32 различных типов в 10 классов на основе молекулярных путей, которые вызывают рост опухоли. Лучшее понимание этих путей потенциально может привести к новым способам диагностики и лечения рака. Исследование опубликовано в журнале Clinical Cancer Research.
"Когда мы изучаем рак на молекулярном уровне, мы понимаем, что не существует единого пути или процесса, который управляет всеми различными типами рака," сказал первый автор д-р. Чад Крейтон, адъюнкт-профессор медицины и член отделения биостатистики Комплексного онкологического центра Дэна Л. Дункана Медицинского колледжа Бейлора.
В прошлых исследованиях подробно изучались виды рака отдельных типов. Например, исследования рака легких определили подтипы рака легких на молекулярной основе, которые представляют различные молекулярные пути, которые были нарушены и привели к росту рака легких.
"В этом исследовании мы хотели найти общие пути распространения рака из разных тканей," Крейтон сказал. "Мы использовали Атлас генома рака, общедоступный набор данных, который позволяет нам посмотреть, что общего у многих видов рака."
Исследователи применили другой вычислительный подход, чтобы вычесть все тканеспецифические различия и определить, какие пути остались. Они проанализировали около 10 000 раковых опухолей человека 32 различных типов и смогли определить 10 основных групп рака, которые они называют классами.
Большинство классов включают рак из разных тканей, которые имеют общие специфические молекулярные пути, которые изменяются и потенциально способствуют росту рака. Затем исследователи определили конкретные гены, которые характеризуют каждый из этих классов, чтобы лучше понять, что делают эти пути.
Измененные пути
"Мы обнаружили класс, у которого была очень высокая экспрессия измененных генов, которые участвуют в иммунной контрольной точке, что относится к опухолевым молекулам, которые сигнализируют иммунным клеткам, отвечающим за разрушение опухоли, чтобы оставить ее в покое," Крейтон сказал. "У других классов были изменены гены в путях, связанных с метаболизмом или стрессом."
Другая подгруппа имела молекулярную сигнатуру нейроэндокринных опухолей, типа опухолей, которые можно найти в широком диапазоне тканей, но у него есть свои уникальные характеристики и профиль.
"Мы ожидали, что около 1% опухолей будут иметь нейроэндокринную подпись, но мы обнаружили, что около 4% опухолей демонстрируют это," Крейтон сказал. "Это представляет собой значительное количество пациентов, если учесть все виды рака у человека."
Несмотря на то, что опухоли изначально не были диагностированы как нейроэндокринные опухоли, они имели признак этого типа рака. Для исследователей это открытие говорит о том, что может быть ряд нейроэндокринных видов рака, которые упускаются из виду.
"Мы считаем, что необходимо пересмотреть тип маркеров для выявления нейроэндокринных опухолей," Крейтон сказал.
Некоторые из биологических путей, выявленных в этом исследовании, уже много лет изучаются в лабораторных условиях.
"Значительное количество раковых заболеваний человека проявляет эти пути, которые, как мы обнаружили, актуальны в лабораторных условиях," Крейтон сказал. "Мы думаем, что очень важно определить пути, по которым рак, по-видимому, растет. Знание этого может быть первым шагом в определении того, как лучше воздействовать на этот конкретный рак."