Международная многопрофильная группа исследователей из ряда учреждений, включая Медицинский колледж Бэйлора, Бригам и женскую больницу, Онкологический центр им. М.Д. Андерсона Техасского университета, Онкологическое агентство Британской Колумбии и Институт Броуда, которые все являются частью Атласа генома рака. Исследовательская сеть завершила комплексную молекулярную характеристику 412 мышечно-инвазивных видов рака мочевого пузыря, в результате чего были идентифицированы пять подтипов рака с различной восприимчивостью к конкретным методам лечения. Результаты, опубликованные в журнале Cell, могут привести к будущим индивидуализированным методам лечения.
"Рак мочевого пузыря – это не одно, а несколько заболеваний," сказал автор-корреспондент д-р. Сет Пол Лернер, директор отделения урологической онкологии и Междисциплинарной программы рака мочевого пузыря, а также профессор урологии и заведующий кафедрой урологической онкологии Бет и Дэйв Суолм в Бэйлор. "Под микроскопом инвазивный рак мочевого пузыря у разных пациентов может выглядеть очень похоже. Мы знаем, что существует множество вариаций, которые могут повлиять на реакцию на лечение и долгосрочную выживаемость. Это исследование обеспечивает гораздо более широкое и уточненное понимание молекулярных основ, связанных с этими вариациями".
В 2014 году исследователи опубликовали в журнале Nature результаты исследования 131 рака мочевого пузыря, в которых была представлена первая комплексная многоуровневая характеристика молекулярных изменений при этом типе рака, что стало важным шагом к персонализированной медицине и отличительной чертой медицины. Проекты Атласа генома рака. Представленное здесь исследование расширило исследование 2014 года гораздо большей когортой, интегрировало больше типов геномных данных и уточнило молекулярные подтипы.
Понимание молекулярных изменений и потенциальных терапевтических целей при раке мочевого пузыря
"В этом исследовании мы утроили количество изученных случаев рака мочевого пузыря со 131 в 2014 году до 412 в 2017 году, что привело к идентификации 32 дополнительных значительно мутировавших генов и добавлению менее распространенных мутаций, которые, по-видимому, связаны с этим раком," сказал доктор. Джон Н. Вайнштейн, заведующий кафедрой биоинформатики и вычислительной биологии онкологического центра им. М. Д. Андерсона Техасского университета. "Эти измененные гены открывают множество возможностей для новых терапевтических вмешательств. Рак мочевого пузыря имеет одну из самых высоких скоростей мутаций, и похоже, что сигнатурный мутагенез APOBEC связан с этим высоким бременем мутаций и вовлечен в до 70 процентов опухолей. Опухоли с наибольшим количеством мутаций и высоким APOBEC связаны с большей выживаемостью, чем в среднем."
Кроме того, интеграция нескольких молекулярных параметров, таких как мутации, амплификация генов, РНК и белковые профили, показала, что рак мочевого пузыря можно разделить не на четыре подтипа, как исследователи определили в 2014 году, а на пять подтипов. Исследователи предполагают, что каждый подтип может быть связан с уникальным ответом на терапию, и это можно проверить в будущих клинических испытаниях.
"Одной из важных особенностей этого исследования является то, что мы сообщаем об анализе выживаемости, о котором мы не сообщали в документе 2014 года," сказал Лернер, который также является членом Комплексного онкологического центра Дэна Л. Дункана в Бейлоре. "Теперь мы можем показать, что сигнатуры мутаций, молекулярные подтипы, количество новых молекул, связанных с раком, в дополнение к известным клиническим и патологическим факторам, очень четко влияют на общую выживаемость пациентов."
Исследователи предлагают принять во внимание полученную информацию о раке мочевого пузыря при разработке клинических испытаний точной медицины. Это исследование и будущие исследования подтипов рака могут однажды помочь врачам лучше подбирать пациентов с конкретными, персонализированными методами лечения, настроенными на конкретные молекулярные сигнатуры и другие биологические характеристики их рака.
"В рамках проекта собрана сокровищница данных – все они теперь общедоступны – которые будут анализироваться, интерпретироваться и повторно интерпретироваться в течение буквально десятилетий исследователями рака мочевого пузыря в интересах пациентов с раком мочевого пузыря и их семей," Вайнштейн сказал.
"По оценкам, рак мочевого пузыря вызывает около 150 000 смертей во всем мире в год, и мы отстаем от других областей рака с точки зрения клинического применения его молекулярных данных и биологии," Лернер сказал. "Тем не менее, мы можем начать понимать, как мы можем использовать эту информацию в будущем, чтобы обеспечить наилучшее лечение для каждого пациента."