Исследователи использовали новую технику, известную как ВЯЗ-seq, чтобы найти последовательности ДНК, каковые сильно увеличивают уровни транскрипции – процесс, которым ген ‘прочтён’, чтобы написать промежуточное сообщение, известное как РНК. Они также искали последовательности, каковые увеличивают эффективность перевода, в то время, в то время, когда сообщения РНК интерпретируются, чтобы выстроить продукты, такие как молекулы белка. Запатентованный метод ВЯЗА-seq сохраняет надежду на косвенное измерение деятельности генетического кода белок, что додаёт определенный химический ‘показатель’ на ДНК. Если ген будет более активным, то он покинет больше тегов на ДНК.
Эти показатели отысканы и измерили использование чувствительного аналитического метода ДНК, известного как громадное, параллельное упорядочивание, обеспечив количественное считывание уровней активности гена.Издавая их результаты в находящемся в открытом доступе издании Nature Communications, исследователи нашли последовательности ДНК для ‘дисков контроля’, каковые последовательно создают высокий уровень активности гена.
Они также показали ранее неизвестную информацию о видах последовательностей ДНК та работа оптимальнее . Интригующе, команда осознала, что самое первое ‘письмо’ (база) сообщения РНК очень принципиально важно для действенной транскрипции генов.
Они также нашли, что трехмерная структура сообщения РНК играется ключевую роль в определении, как замечательно РНК будет переведена, чтобы сделать белки, а не определенные последовательности, каковые, как ранее думали, были важны для действенного перевода.«Прошлые методы, каковые употреблялись, чтобы изучить последовательности контроля за ДНК как правило, сохраняют надежду на сортировку клеток приятель за втором и измерение активности гена в каждом из них», говорит доктор Ева Юс, ведущий создатель статьи. «Но отечественный новый подход использует ультрасовременную разработку упорядочивающего ДНК, чтобы совсем правильно измерить эффекты тысяч последовательностей на активности гена одновременно с этим».У микоплазмы pneumoniae имеется очень небольшой геном, что делает достаточно легким обучаться. Но в то время как это изучение доказало, что техника трудится в несложном организме, это имело возможность также быть применено к вторым бактериальным разновидностям, дрожжам или помимо этого клеткам человека, чтобы найти нужную информацию о том, как руководят генами и как ими вероятно руководить.
«Если мы хотим использовать бактерии или другие клетки для приложений биотехнологии, мы должны спроектировать их, чтобы сделать солидную сумму продукта. Но это очень не легко, если у нас нет информации об оптимальных последовательностях для управления генами», говорит доктор Цзэ-Сен Ян, соавтор изучения.Вследствие того что Микоплазма pneumoniae как правило передаёт легкие, команда на данный момент планирует использовать их новое знание, чтобы развивать методы лечения на базе генетически спроектированных бактерий для лечения заболеваний легких. Их цели включают заразе легких, рак, и приближается для регенерации поврежденной ткани.
«У нас на данный момент имеется огромный диапазон последовательностей контроля, каковые мы можем использовать, чтобы приспособить уровни белков, каковые мы хотим произвести в легких – как набор инструментов, что мы можем использовать, чтобы руководить активностью гена», растолковывает профессор Серрано. «Кроме этого, эта техника – очень недорогой и стремительный способ найти последовательности, управляющие транскрипцией и переводом, и имела возможность употребляться для любого применения биотехнологии или организма».