Комплексное исследование онкологического центра Линебергера Университета Северной Каролины продемонстрировало способность когнитивных вычислений обрабатывать большие объемы данных из научных исследований и баз данных для выявления потенциально релевантных клинических испытаний или терапевтических вариантов для больных раком на основе генетики их опухолей.
Исследователи заявили, что их результаты, опубликованные в журнале The Oncologist, предполагают, что приложения для когнитивных вычислений могут помочь врачам быть в курсе постоянно растущего объема научной литературы, а также выявить потенциальные терапевтические варианты, особенно в том, что касается генетики рака.
"Наши результаты, хотя и предварительные, демонстрируют, что когнитивные вычисления могут играть роль в определении дополнительных терапевтических возможностей для больных раком," сказал Уильям Ким из UNC Lineberger, доктор медицины, автор-корреспондент исследования и доцент медицины и генетики в Медицинской школе UNC. "Я могу сказать вам, что как практикующий онколог, пациенты очень обнадеживают, когда узнают, что мы способны систематически изучать для них все возможные варианты."
Первыми авторами исследования были Нирали Патель, доктор медицины, ранее работавший в UNC Lineberger, и Ванесса Мишелини из IBM Watson Health, Бока-Ратон, Флорида. IBM Corp. предоставил доступ в натуральной форме к технологии Watson для исследования, а также получил техническую экспертизу.
Исследователи использовали IBM Watson for Genomics, чтобы оценить, были ли когнитивные вычисления более эффективными, чем группа экспертов по раку, при определении вариантов лечения опухолей с конкретными генетическими аномалиями. Они сравнили способность Watson выявлять возможные терапевтические варианты, связанные с потенциально клинически значимыми генетическими мутациями, с выводами совета по молекулярным опухолям UNC Lineberger.
В ретроспективном анализе 1018 случаев рака совет по молекулярным опухолям выявил действенные генетические изменения в 703 случаях, что также подтвердил Уотсон. Кроме того, Watson for Genomics выявила дополнительные потенциальные терапевтические возможности у 323 пациентов, или в одной трети рассмотренных случаев, которые не были идентифицированы комиссией по молекулярным опухолям. Из них 96 ранее не были идентифицированы как имеющие действенную мутацию.
"Чтобы быть ясным, дополнительные 323 случая идентифицированных Ватсоном изменений, которые могут быть применены, состояли только из восьми генов, которые не были сочтены действующими комитетом по молекулярным опухолям," Ким сказал. В большинстве случаев Уотсон проводил новое клиническое испытание. Одно из этих испытаний началось в течение недели после анализа Уотсона.
Исследование основывалось на данных UNCseq, клинического испытания UNC Lineberger, в котором использовалось секвенирование следующего поколения для анализа геномики опухоли участника с целью сопоставления опухолевых аномалий с целевым терапевтическим средством. Секвенирование следующего поколения – это "фундаментальный" к обещанию точной медицины, сообщили исследователи, но секвенирование может выявить множество различных изменений в сотнях генов, и "Большинство таких событий не имеют известного отношения к лечению больных раком."
"Главный вывод заключается в том, что когнитивные вычисления расширили процесс анализа молекулярных опухолей для интерпретации и сбора информации о геномном профиле пациента," Ким сказал. "Исследование не было разработано для анализа того, помогает ли это пациентам в отношении исхода, определяемого продолжительной выживаемостью или ответом на лечение."
Программа действительно определила новые возможные варианты для некоторых пациентов. Результаты не относились к большинству пациентов, потому что у большинства пациентов не было активного рака или они умерли к моменту ретроспективного анализа. Но для 47 пациентов с активным заболеванием, нуждающихся в дополнительных вариантах, результаты были доложены их лечащим врачам.
"Насколько мне известно, это первое опубликованное исследование полезности когнитивных вычислений в точном лечении рака," Ким сказал. "Я оптимистично настроен, что по мере того, как мы получим больше данных о секвенировании, хорошо аннотированной информации о лечении, а также о реакции на терапию, такие инструменты, как Watson for Genomics, начнут давать свои истинные обещания. Но, конечно, нам еще нужно формально ответить на эти вопросы."